So sánh các phương pháp tách chiết DNA/RNA trong thực phẩm phục vụ kiểm tra VSATTP
Tách chiết được DNA/RNA từ nền mẫu thực phẩm đủ tinh sạch và nồng độ phù hợp để sử dụng cho các bước định danh (PCR, qPCR, giải trình tự), ngay cả với các nền mẫu nhiễu cao như gia vị, thực phẩm béo, thịt chế biến, hải sản tẩm ướp…
1. Phương pháp tách chiết thủ công bằng đệm ly giải + phenol/chloroform
-
Cơ chế: Dùng SDS/lysozyme + phenol/chloroform tách lớp → lấy DNA.
-
Ưu điểm:
-
Chi phí thấp.
-
Có thể điều chỉnh từng bước theo từng loại mẫu.
-
-
Hạn chế:
-
Quá trình thủ công, dễ sai lệch.
-
Rủi ro nhiễm độc từ hóa chất.
-
Hiệu suất không ổn định với nền mẫu giàu chất béo hoặc nhiều polyphenol (ớt, tiêu…).
-
-
Khuyến nghị sử dụng: Không phù hợp cho kiểm nghiệm định kỳ thực phẩm.
2. Tách chiết dùng kit cột silica (spin column)
-
Nguyên lý: DNA liên kết với cột silica trong điều kiện chaotropic salt → rửa → ly giải.
-
Ưu điểm:
-
Phổ biến, dễ dùng, chuẩn hóa tốt.
-
Có thể chọn kit chuyên dụng cho mẫu giàu lipid, gia vị.
-
-
Hạn chế:
-
Chi phí hơi cao nếu sử dụng nhiều mẫu.
-
Một số mẫu vẫn gây hiện tượng PCR inhibition nếu không có bước loại chất ức chế.
-
-
Thích hợp cho:
-
Mẫu thịt, cá, gia cầm, thủy sản chế biến.
-
Mẫu gia vị (nếu dùng dòng kit có bước hấp thụ chất ức chế như polyphenol).
-
3. Phương pháp dùng hạt từ tính (magnetic beads)
-
Cơ chế: DNA gắn vào bề mặt hạt từ được phủ silica/magnetizable polymer → tách bằng nam châm.
-
Ưu điểm:
-
Tự động hóa dễ dàng (robot, bán tự động).
-
Tách sạch DNA khỏi lipid, polyphenol, muối…
-
Phù hợp nền mẫu ớt, tiêu, dầu mỡ.
-
-
Hạn chế:
-
Cần máy từ hoặc máy bán tự động.
-
Giá kit cao hơn cột silica.
-
-
Ứng dụng:
-
Phòng lab thực phẩm ISO 17025, kiểm tra PCR vi sinh hằng ngày.
-
⚙️ Giải pháp tích hợp tại Cao Gia:
-
Máy tách chiết tự động 16/32 mẫu dùng hạt từ.
-
Kit hạt từ dành riêng cho mẫu thực phẩm béo/gia vị.
4. Phương pháp ly giải tế bào + lọc trực tiếp (thô)
-
Cơ chế: Ly giải nhanh (heat + lysis buffer), lọc lấy dịch siêu lọc → đưa thẳng vào PCR.
-
Ưu điểm:
-
Nhanh, giá rẻ, dùng trong test nhanh.
-
-
Hạn chế:
-
DNA chứa nhiều chất ức chế.
-
Không phù hợp mẫu nhiễu cao hoặc yêu cầu độ nhạy cao.
-
-
Ứng dụng:
-
Kiểm tra sàng lọc, test định tính nhanh.
-
So sánh tổng quan
| Tiêu chí | Phenol/Chloroform | Cột silica | Hạt từ tính | Ly giải thô |
|---|---|---|---|---|
| Hiệu suất tách mẫu béo/gia vị | Thấp | Trung bình–cao | Rất cao | Thấp |
| Tự động hóa | Không | Có khả năng | Tốt nhất | Hạn chế |
| Hiệu quả PCR/qPCR sau đó | Kém nếu nhiễm tạp | Tốt nếu dùng đúng kit | Rất tốt | Yếu |
| Chi phí/lần | Rẻ nhưng độc hại | Trung bình | Trung – Cao | Cực rẻ |
Khuyến nghị lựa chọn theo loại mẫu
| Nền mẫu | Phương pháp khuyến nghị |
|---|---|
| Thịt/cá/chế biến sẵn | Cột silica hoặc hạt từ |
| Ớt, tiêu, gia vị khô | Hạt từ tính hoặc silica chuyên dụng |
| Thực phẩm giàu chất béo (dầu, pate) | Hạt từ tính hoặc kit loại lipid |
| Mẫu định tính nhanh sàng lọc | Ly giải thô + PCR nhanh |
✅ Giải pháp tại Cao Gia Biotech
Cao Gia cung cấp trọn bộ:
-
Kit tách chiết DNA/RNA thực phẩm nhiều nền mẫu (gia vị, dầu mỡ, thịt chín).
-
Máy tách chiết tự động mini 16/32 mẫu với giá hợp lý.
-
Giải pháp kết hợp với PCR định danh vi khuẩn: Salmonella, Listeria, E. coli O157…
👉 Liên hệ đội kỹ thuật Cao Gia Biotech để có được đối tác đồng hành đáng tin cậy!
Tại Cao Gia Biotech, chúng tôi không chỉ cung cấp thiết bị – mà còn đồng hành trong từng bước từ lựa chọn, đào tạo, đến tối ưu quy trình để đảm bảo bạn khai thác tối đa hiệu quả đầu tư.
CÔNG NGHỆ SINH HỌC CAO GIA
Trách nhiệm – Khoa học – Khát vọng
